Из особо почитаемых святынь отметим возвратившуюся после реставрации в иконостас главного храма обители Смоленскую икону Божией Матери – вклад инокини Марфы - и икону Божией Матери “Всецарица” – точный список с чудотворного образа, находящегося в монастыре Ватопед на Святой Горе Афон. Список был выполнен специально для Новоспасского монастыря афонскими монахами после продолжительных молитв всей братии Ватопедской обители. Икона получила освящение от самого чудотворного образа. Ее торжественное принесение в Москву совершилось в 1997 г., и с тех пор многочисленные богомольцы усердно прибегают к заступлению Царицы Небесной, в молитве у Ее образа прося исцеления и помощи.

К особым святыням обители относятся два ковчега-мощевика: один с частицами святых мощей преподобных отцов Киево-Печерских, другой – с частицами Ризы Господней, Ризы Божией Матери, Животворящего Креста Господня, частицами мощей святых апостолов, вселенских и русских святых, среди которых – апостол и евангелист Марк, апостол Варнава, святители Иоанн Златоуст и Спиридон Тримифунтский, великомученик Пантелеимон и великомученица Варвара, Первосвятители Московские, святители Игнатий и Димитрий Ростовские, Феофан Затворник, преподобные Серафим Саровский, Кирилл и Мария Радонежские, преподобные Оптинские старцы, святой Василий Блаженный, священномученик Владимир, митрополит Киевский и Галицкий, преподобномученица великая княгиня Елисавета и другие святые.

Икона Божией Матери "Всецарица" - список с чудотворного образа, находящегося в Ватопедском монастыре, принесенная с Афона в дар монастырю в июле 1997 г.	Икона Божией Матери "Смоленская" (чтимая) - вклад инокини Марфы, матери царя Михаила Федоровича (XVI в.).	Икона св. мц. Татианы с частицей мощей

Первый мощевик с частицами мощей вселенских и русских святых

Крест с мощами: свтт. Василия Великого, Григория Богослова, Иоанна Златоуста св.вмцц. Екатерины и Варвары св. мч. Меркурия прп. Иоанна Дамаскина св. благ. кн. Владимира и прочих свв

Часть Ризы Господней Часть Ризы Божией Матери свтт. Московских св. ап. Варнавы св. бл. кн. Дмитрия Углического прп. Серафима Саровского свт. Спиридона Тримифунтского св. мчч. Гурия и Авива св. вмч. Пантелеимона свв. мчч. младенцев Вифлиемских свт.Феофана Вышенского прпп. Кирилла и Марии (родителей прп.Сергия Радонежского) сщмч. Владимира Киевского прмц. вел. кн. Елисаветы св. Василия блаж. Московского прпп. отцев Оптинских прп. Давида Гареджийского свт. Дмитрия Ростовского прп. Сергия Радонежского свт. Николая Чудотворца св. мч. Иоанна Воина св. вмч. Дмитрия  Солунского и прочих свв.

Иконы в Покровском храме с мощами святых
прп. Серафима Саровского	прпп. Иова и Амфилохия Почаевских	прп. Анны Кашинской	св. мц. кн. Людмилы Чешской

Второй мощевик с частицами  мощей  Киево-Печерских святых	Пояс святого праведного Иоанна Кронштадтского в киоте с новонаписанной иконой святого